DNA片段大小分析 变性高效液相色谱技术（ DHPLC）是一种简单，快速，非凝胶的核酸分析方法，应用离子对反相液相色谱原理进行DNA变异检测，该技术灵敏度和特异性非常高， 另一个优点是 PCR产物在DHPLC分析前不需要进一步的纯化。 DHPLC 在 50℃ 条件分析样品，样品峰的洗脱只由碱基对的数量决定洗脱顺序。这种应用在非变性条件下能将染色体插入和缺失片段分开。一般说来，产物分子量的 1% 大小的片段能够被分离。例如， 100bp 的产物能和 101bp 的产物分开， 300bp 的产物能和 303bp 的产物分开。分子量较小的核酸片段含有相应较少的 磷酸盐基团结合柱基质，而分子量较大的片段则含有 较多的磷酸盐基团结合柱基质。因此，当我们将过柱的 乙腈浓度提高，核酸片段就会根据分子量从小到大的顺序被洗脱出来。 WAVE专用 TM 软件能根据 DNA 片段分子量大小标志对系统进行刻度，每个样品的片段大小就可以自动给出。 DHPLC 技术在这种工作模式下，主要用于 PCR 产物质量检测和纯化、微卫星不稳定分析、杂合性缺失分析和基因定量分析等。
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